A HungaroControl Magyar Légiforgalmi Szolgálat tevékenységének gazdasági társasági formába szervezését követően 2007. január 1-jétől az Állami Privatizációs és Vagyonkezelő Zrt.-hez rendelt egyszemélyes, zártkörűen működő részvénytársaságként működik.
Az ötven millió forint jegyzett tőkével megalakult HungaroControl Zrt. jegyzett tőkéjét - a vonatkozó kormányhatározatnak megfelelően - 5350 milliárd forinttal emelték meg, amelynek forrása a megszüntetett költségvetési intézmény készpénzállománya volt.
Ezen túl, az ingatlanok kivételével az eszközök és vagyoni jogok, 14,339 milliárd forint tőkeemeléssel a HungaroControl Zrt. tulajdonába kerülnek. Az apporthoz össze kell állítani a társaság mérlegét a 2006 december 31-iki fordulónappal, ami a hónap közepére készülhet el, így az újabb tőkeemelés a hónap végéig megtörténhet - fűzték hozzá a gazdasági tárcánál.