A Bécshez és Pozsonyhoz közeli erőmű üzemeltetése ellen Ausztria hosszú ideig tiltakozott, és nem fogadta el a szlovák érvelést, miszerint az 1960-as években épült atomerőmű a felújítás után olyan, mintha új lenne. A bezárás határidejét az EU csatlakozási szerződésben 2006-2008-ra jelölték meg.
Emlékezetes botrányt kavart annakidején az előző szlovák kormány gazdasági minisztere, Pavol Rusko, aki a kötelezettség ellenére épp Bécsben jelentette ki, hogy az atomerőműre az áramönellátás miatt szüksége van az országnak, ezért nem fogják bezárni. Rusko később megbukott, pártja, az ANO (Új Polgári Szövetség) elolvadt.
Az erőmű első reaktorát a szerződésnek megfelelően 2006 utolsó napján leállították. A második reaktorblokk még ez év végéig áramot termel. A blokk januárban 308 783 megawatt elektromos áramot termelt, írta szerdán a Hospodárské Noviny című szlovák gazdasági napilap.
A Jaslovské Bohunice-i erőmű termelését pótlandó Robert Fico kormánya úgy döntött, hogy befejezik a magyar határhoz közel lévő, a Léva (Levice) tőszomszédságában működő mohi (Mohovce) atomerőművet, azaz felépítik annak harmadik és negyedik blokkját, amelynek építését pénz híján 1992-ben leállították, de az állagmegóvási munkák még 2004 során is folytak. A harmadik és a negyedik blokkra az építkezés leállításáig minden járulékos költséggel - közte a hitelkamatokkal - együtt kis híján 20 milliárd koronát költött Szlovákia, a befejezésig az építkezés még 60 milliárdot emészt fel, jóllehet a munkálatok leállításakor a két befejezendő blokk épületei 70 százalékban már elkészültek, a technológiai berendezések 30 százaléka pedig már a helyén volt.
