A 2006. évi Magyar Innovációs Nagydíjat a budapesti Mediso Orvosi Berendezés Fejlesztő és Szerviz Kft. által megvalósított "NanoSPECT/CT in vivo kisállatvizsgáló-rendszer" innováció kapta.
Egyed Géza, a Gazdasági és Közlekedési Minisztérium (GKM) szakállamtitkára hangsúlyozta, hogy a globális gazdaság kihívásaira a magyar válasz az innováció lehet. A szakállamtitkár emlékeztetett arra, hogy a kormány nemrégiben elfogadta a középtávú tudományos- és technológiai innovációs stratégiát. A keretdokumentum alapján készül az intézkedési terv, amelyet társadalmi egyeztetésre bocsátanak.
Závodszky Péter, a Magyar Innovációs Alapítvány elnöke elmondta, nagy reményt fűznek az innovációs stratégiához, amely kijelöli a magyarországi kutatás-fejlesztés, az innováció pilléreit.
A GKM 2006. évi Ipari Innovációs Díj elismerését a "Dunaújvárosi Duna-híd" kapta a Hídépítő Speciál Kft., a Ganzacél Zrt., a Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem, a Hidak és Szerkezetek Tanszéke és a Barabás Mérnökiroda Kft. megvalósításában.
A Környezetvédelmi és Vízügyi Minisztérium 2006. évi Környezetvédelmi Innovációs Díját a "Világelső hibridhűtés a Mátrai Erőmű Zrt. V. blokkján" innovációja kapta. Megvalósítója az Alstom Power Hungária Zrt. és a Mátrai Erőmű Zrt.
A Földművelésügyi és Vidékfejlesztési Minisztérium 2006. évi Agrár Innovációs Díját a "Rita, Carmen és Axel magyar nemesítésű cseresznyefajták termesztésbe
vonása" érdemelte ki az Érdi Gyümölcs- és Dísznövénytermesztési Kutató-Fejlesztő Kht. megvalósításában.
A Nemzeti Kutatási és Technológiai Hivatal (NKTH) 2006. évi Technológiai Innovációs Díj elismerésében a "Napelemgyártó berendezés és komplett, önálló gyártósor" innováció részesült a KPE Kraft Project Elektronikai Kft. megvalósításában.
A Magyar Szabadalmi Hivatal 2006. évi Innovációs Díját a "RIPEDON 1 mg, 2 mg, 3 mg, 4 mg tabletta" érdemelte ki. Megvalósítója az Egis Gyógyszergyár Nyrt.
A Magyar Kereskedelmi és Iparkamara 2006. évi Innovációs Díj elismerést pedig a "Saját technológián alapuló, új poliuretán alapanyaggyártó üzem a BorsodChem Nyrt.-nél" kapta.